В центре сюжета остросюжетного фильма «Код апокалипсиса» - агент ФСБ Мари, которая несколько лет назад была внедрена в международную террористическую организацию.Преступник номер 1 Джаффад Бен Зайиди в свое время украл с претерпевшей крушение американской подлодки четыре ядерных боеголовки. Добычу он спрятал в четырех разных мегаполисах. Бомбы были запрограммированы таким образом, что в действие они приводятся 11-тизначным кодом. По одной части кода знают три приближенных Джафада. Активировать боеголовки можно, только сложив воедино все цифры и получив 11-тизначное число.После гибели террориста его бывший подельник по кличке Палач решает активировать бомбы. Чтобы этого не допустить, ЦРУ и ФСБ решают объединить усилия, они делают все возможное, чтобы поймать преступника. Судьба всего человечества находится в руках Мари, которую когда-то внедрили в группировку Джаффада в качестве тайного агента…