В центре сюжета сериала «Андреевский флаг» - жизнь семьи Чернобаевских. Глава семейства Григорий Сергеевич после торжественных проводов на пенсию возвращается домой и надеется на тихую, спокойную жизнь. Лучшие годы он провел в Балтийском флоте, где дослужился до звания вице-адмирала, завоевал авторитет и уважение коллег. Он не умеет жить на суше, постоянно думает о море, но полон намерений наконец-то уделить время семье, ведь в молодости он не мог себе этого позволить. Мужчина переживает за судьбу сына Сергея, который пошел по его стопам, его беспокоят отношения с дочерью, будущее внука Валерия, который все никак не может выбрать профессию. Однако все эти переживания окажутся мелочами по сравнению с теми злоключениями, которые ждут Григория и его родных в ближайшем будущем…