События детективного сериала «Шифр» (сезон 2) разворачиваются в Москве в 1957 году. Главные героини - Софья, Ирина, Анна и Катерина занимаются расследованием самых запутанных преступлений. Вот только подполковнику МУРа Проскурину не нравится то, что девушки вмешиваются в расследования важных дел государственной важности. И все же Проскурин вынужден обратиться к ним за помощью, ведь он понимает, что эти таланты обладают совершенно уникальными аналитическими способностями. Меняется многое и в жизни главных героинь. Так, Соня официально разошлась с Виктором, теперь она служит в МУРе и у нее бурный роман с Кимом Вершининым, помощником Проскурина. Вот-вот, и молодые люди поженятся, если, конечно, жизнь не внесет в их планы свои коррективы.