События мультсериала «Евангелион» разворачиваются в далеком будущем, когда прошло пятнадцать лет после глобальной катастрофы, поставившей человечество на грань выживания. Тех, кому удалось выжить, ждут еще более страшные испытания - Землю атакуют Ангелы, загадочные гигантские существа из глубин далекого космоса. Единственное оружие на планете, способное им противостоять - роботы серии Евангелион, которых создали с помощью биотехнологий. Сражаться с помощью этих гигантских машин способны только те солдаты, которые могут полностью синхронизировать себя с роботом и управлять им так, будто это их тело. Бойцы обучаются и живут в секретном подземном городе Токио-3. Главные герои – три бойца Синдзи, Асука и Рэй, которые давно являются непримиримыми врагами, но именно от них зависит судьба планеты и разгадка тайны зловещих Ангелов.