События мультсериала «Внутренние покои» разворачиваются в тяжелые времена, когда страшная эпидемия уничтожила почти всех мужчин. Выжить удалось только самым сильным – настоящим самураям и их потомкам. На протяжении восьмидесяти лет остатки мужчин выполняют только одну задачу – продолжение рода. Эсимунэ Тогава – великая правительница, в дворце которой есть гарем с мужчинами, но именно при ней начинается хаос и анархия. Среди мужчин начинается ожесточенная борьба за право доминировать, они ведут себя, как пауки в банке. Эсимунэ решает отправить самых дерзких в другие города, чтобы заодно снизить траты на этих бездельников. Как раз в этот сложный момент Эсимунэ находит летопись последних восьмидесяти лет, где объясняется, почему все правительницы рода Тогава носили мужские имена.